DAP-seq實(shí)驗的原理

DAP-seq實(shí)驗的原理

基于DNA親和純化，通過(guò)體外表達轉錄因子鑒定TFBS的技術(shù)，具有不受抗體和物種限制，且高通量的優(yōu)勢，自該技術(shù)問(wèn)世以來(lái)，已被廣泛應用于轉錄調控和表觀(guān)組學(xué)的研究。能幫助您快速找到轉錄因子的結合位點(diǎn)，尋找轉錄因子調控的靶基因。

DAP-seq是ChIP-seq的重要補充方法，可以應用于模式和非模式物種，一般來(lái)說(shuō)，有參考基因組的物種都可以進(jìn)行DAP-seq，如果沒(méi)有參考基因組，數據下機之后是無(wú)法進(jìn)行數據分析的，但是可以考慮使用近緣物種的參考基因組進(jìn)行分析。

藍景科信河北生物科技有限公司 客戶(hù)發(fā)表文章：

2022年8月，廣西大學(xué)農學(xué)院甘蔗生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室/亞熱帶農業(yè)生物資源保護與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗室張木清/姚偉研究團隊在Journal of Experimental Botany（IF=7.298）在線(xiàn)發(fā)表了題為“ScAIL1 modulates plant defense responses by targeting DELLA and regulating GA and JA signaling"的研究論文，該研究發(fā)現了一個(gè)甘蔗新的AP2家族轉錄因子ScAIL1，通過(guò)靶向DELLA調節JA與GA合成，平衡植物生長(cháng)與防御。

2022年8月，安徽農業(yè)大學(xué)、中國水稻研究所和上海市農業(yè)科學(xué)院作物育種栽培研究所在The Plant Journal（IF=5.726）期刊聯(lián)合發(fā)表了題為“OsSGT1 promotes melatonin-ameliorated seed tolerance to chromium stress by affecting the OsABI5-OsAPX1 transcriptional module in rice"的文章，揭示了OsSGT1和ABI5相互作用，調控OsAPX1的表達，促進(jìn)褪黑素改善種子在鉻污染條件下萌發(fā)的分子機制。

2022年8月，揚州大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、植物功能基因組學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗室高勇課題組在The Plant Cell（IF=12.085）上在線(xiàn)發(fā)表了題為“Phytochrome Interacting Factor Regulates Stomatal Aperture by Coordinating Red Light and Abscisic Acid"的研究論文，揭示了光敏色素互作因子（phytochrome interacting factors, PIFs）通過(guò)協(xié)調紅光和脫落酸（ABA）信號調節氣孔開(kāi)度的分子機制。

2022年7月，北京市農林科學(xué)院玉米DNA指紋及分子育種北京市重點(diǎn)實(shí)驗室、齊魯師范大學(xué)玉米分子育種研究院的共同研究成果，在Theoretical and Applied Genetics(IF=5.574)上發(fā)表，題目為“ A newly characterized allele of ZmR1 increases anthocyanin content in whole maize plant and the regulation mechanism of diferent ZmR1 alleles"。本文主要研究?jì)热菔氰b定了玉米花青素合成相關(guān)等位基因ZmR1CQ01，并揭示了3個(gè)ZmR1等位基因的生物學(xué)功能和分子調控機制。

2022年5月，中科院植物所王雷研究組在Plant Physiology（IF=8.005）期刊上發(fā)表了題為“Rice CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1 transcriptionally regulates ABA signaling to confer multiple abiotic stress tolerance"的研究成果。該研究揭示了OsCCA1調控水稻適應鹽脅迫、干旱脅迫以及滲透脅迫的分子機制。其中，該研究使用了DNA親和純化測序技術(shù)（DAP-seq，DNA Affinity Purification Sequencing），鑒定了水稻生物鐘核心組分OsCCA1（Oryza sativa CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1）調控的下游靶基因。

2020年4月，北京工商大學(xué)與藍景科信合作，Biochemical and Biophysical Research Communications（IF=3.322）發(fā)表了題為“ Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling"的文章，為揭示PIFs轉錄因子調控ABA信號轉導機制提供了重要線(xiàn)索。

2019年9月，北京林業(yè)大學(xué)和藍景科信合作，在植物學(xué)主流學(xué)術(shù)期刊Journal of Experimental Botany上（IF=5.36），發(fā)表了題為“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H±ATPase gene to enhance gene expression and salt tolerance"的研究成果。該研究借助DNA親和純化測序（DNA Affinity Purification Sequencing，DAP-seq）技術(shù)，深入揭示了胡楊耐鹽的分子機制。