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DAP-seq:轉錄因子結合位點(diǎn)研究新方法

更新時(shí)間:2024-07-01

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DAP-seq:轉錄因子結合位點(diǎn)研究新方法
DAP-Seq將蛋白質(zhì)體外表達技術(shù)與高通量測序技術(shù)相結合,不需要針對每個(gè)轉錄因子制備特異性抗體,所以DAP-Seq具有快速、高通量、節約時(shí)間成本等顯著(zhù)優(yōu)勢,比ChIP-seq更易于擴展。
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DAP-seq:轉錄因子結合位點(diǎn)研究新方法


在功能基因組學(xué)和表觀(guān)遺傳學(xué)研究中,轉錄因子結合位點(diǎn)(TFBS)的發(fā)掘一直是研究熱點(diǎn)。傳統的ChIP-seq(染色質(zhì)免疫共沉淀測序)方法,在抗體質(zhì)量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而,好的抗體可遇不可求,這限制了ChIP-seq更廣泛的應用。


DAP-seq技術(shù)的出現,使TFBS 的研究不再局限于物種,不再受抗體質(zhì)量的限制,為生命科學(xué)領(lǐng)域轉錄因子的研究提供了新的有效工具。


DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過(guò)體外蛋白表達技術(shù),表達出帶有標簽的轉錄因子,和基因組DNA文庫在體外進(jìn)行結合,然后分離出所有與轉錄因子結合的DNA,再使用高通量測序,找到轉錄因子的結合位點(diǎn)。


藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術(shù)服務(wù)和個(gè)性化數據分析,具有100多個(gè)物種,2000多個(gè)轉錄因子的實(shí)戰經(jīng)驗。歡迎咨詢(xún)。



DAP-seq:轉錄因子結合位點(diǎn)研究新方法


服務(wù)內容:

服務(wù)項目周期交付結果
蛋白表達載體構建1-2周

構建載體的測序結果

實(shí)驗過(guò)程圖

原始測序數據

分析結果

蛋白無(wú)細胞表達1-2周
DAP-seq文庫構建1周
DNA親和純化1-2周
上機測序2周
標準數據分析2周

       



已做物種:

植物

擬南芥

莖瘤芥

甘藍型油菜

白菜型油菜

不結球白菜

菜心

小麥

大麥

花生

辣椒

番茄

草莓

黃花棘豆

苦蕎

紅薯

木薯

馬鈴薯

普通煙草

人參

鴨茅

罌su

甘蔗

短芒大麥草

二色補血草

煙草

百脈根

芍藥

丹參

狗尾草

菠菜

玉米

大豆

高粱

藜麥

陸地棉

甜瓜

黃瓜

葡萄

灰氈毛忍冬

粉葛

三葉青

獼猴桃

香蕉

蒺藜苜蓿

紫花苜蓿

伴礦景天

苔蘚

地錢(qián)

毛果楊

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84K

小黑楊

胡楊

山新楊

小葉楊

歐美楊

大青楊

毛白楊

剛毛檉柳

白樺

光皮樺

油松

毛竹

麻竹

銀杏

油桐

荔枝

柑橘

甜橙

歐洲云杉

核桃

柿子

閩楠

木荷

臍橙

板栗

杜梨

蘋(píng)果

櫻桃

麻瘋樹(shù)

茶樹(shù)

月季

海島棉

白木香

橡膠樹(shù)

三角褐指藻

芥藍

藍花耬斗菜

鹽芥

無(wú)花果

菠蘿

西瓜

甘薯

竹葉花椒

玫瑰

動(dòng)物

飛蝗

新孢子蟲(chóng)

煙粉虱

草地貪夜蛾

真菌

擬輪枝鐮孢菌

豬苓真菌

意大利青霉

草酸青霉

腐霉

金黃殼囊孢

靈芝

糙皮側耳

草菇

灰蓋鬼傘

蟲(chóng)草

亞洲鐮刀菌

蝗綠僵菌


細菌

路德維希腸桿菌

嗜熱厭氧桿菌

生氮假單胞菌

伯克赫爾德氏菌

布魯氏菌

肺炎克雷伯菌


     







相關(guān)服務(wù):

1、 凝膠阻滯實(shí)驗(EMSA):DAP-seq后續驗證服務(wù)。

2、 酵母單雜交:DAP-seq后續驗證服務(wù)

3、 ChIP-seq:高效檢測重組蛋白、轉錄因子在基因組的結合位點(diǎn)

4、 DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析: 分析轉錄因子的靶基因在RNA-seq數據中的表達變化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數據,增加轉錄組測序的分析深度。

5、 DNA-pull down:鑒定與DNA結合的蛋白。

6、 精美的論文圖片設計與制作:專(zhuān)業(yè)設計師,設計精美論文插圖,提升論文的嚴謹性和美觀(guān)度。


DAP-seq:轉錄因子結合位點(diǎn)研究新方法

DAP-seq是基于DNA親和純化,通過(guò)體外表達轉錄因子鑒定TFBS的技術(shù),具有不受抗體和物種限制,且高通量的優(yōu)勢,自該技術(shù)問(wèn)世以來(lái),已被廣泛應用于轉錄調控和表觀(guān)組學(xué)的研究。能幫助您快速找到轉錄因子的結合位點(diǎn),尋找轉錄因子調控的靶基因。


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